有關於李奧納多達文西（Leonardo da Vinci）的傳說，已經多到不勝枚舉，包括他曾遇過外星人，甚至與聖杯有著重大的關係，甚至傳說他曾與神接觸過，與尼可拉特斯拉（Nikola Tesla）一樣，有著最接近神的男人稱號。
也因為這些傳說，李奧納多達文西的真實身份，不但是個謎團，甚至他的作品，也被許多人認為，藏有一些暗示。至於為何他會將暗示藏在創作中，因為當時如提出外星人等話題，就會被視為異端，處以死刑，所以他將這些秘密，藏在著作中，讓後世的人來發掘。許多人就開始，試圖解開他畫中的秘密。
其中最引人矚目的，就是蒙娜麗莎（La Gioconda）的畫作，除了女主角真實身份是個謎團外，其畫作也是一個謎。有個國外的解謎高手，就將蒙娜麗莎這幅畫反轉180度，讓臉部朝左。再將朝左的臉部與朝右的臉部重疊，結果出現蜥蜴人的臉。接著再將蒙娜麗莎左右相反的畫作，各自將臉部朝外後，拼起來，就會見到一個外星人的臉。這個外星人，有可能是蜥蜴人的首領。
換句話說，李奧納多達文西應曾見過蜥蜴人，所以透過蒙娜麗莎這幅畫，傳達蜥蜴人的訊息，給其他能夠破解此謎團的人。有關蜥蜴人的傳說，一直到近代，才逐漸傳了開來。在當時，是不可能從任何地方得知這類訊息，且在處死異端風氣鼎盛時期，更沒有人敢公開談論蜥蜴人的事。所以國外人士推測，李奧納多達文西確實有見到蜥蜴人，更有可能他已與蜥蜴人或是首領接觸過。
李奧納多達文西的另一幅畫，戴頭盔的戰士（Profile of a Warrior in Helmet），同樣也藏著另一個秘密。這個戴頭盔的戰士，是仿照他老師的安德烈德爾委羅基奧（Andrea del Verrocchio）的畫作。國外解謎專家認為，雖然畫得非常像他老師的作品，但他有稍微修改過。解謎專家將這幅畫，左右反轉180度後，再將兩張左右相反的畫作，上下反轉180度，並重疊起來。這時，可以見到傳說中的聖杯。這個聖杯，就是當時最後晚餐上的聖杯，也是亞瑟王與最後的圓桌武士，所尋找的聖杯。
他的另一幅畫作，施洗者聖約翰（St. John the Baptist），也同樣藏有外星人的暗示。國外解謎專家，將這幅畫左右反轉180度後，再將兩幅畫的聖約翰，以面對面的方向拼起來，就會很清楚地見到外星人的臉。這個外星人的臉，與蒙娜麗莎的蜥蜴人首領長相，不謀而合。更因此確定，他的確有與外星人接觸過，或至少見過。當然也有人說，他本身就是外星人。
最後一幅畫，也是最著名的，最後的晚餐（l'ultima cena）。這幅畫不但被多次拿來作為，李奧納多達文西暗示的範例，甚至丹布朗（Dan Brown），更將此畫作，寫進達文西密碼（The Da Vinci Code）一書內。而在國外解謎專家的查看下，發現這幅畫，所隱藏的暗示，較他所有畫作，是有過之而無不及。
其中，最有名的就是十二個門徒的排列，有人認為，十二名使徒代表黃道十二宮，耶蘇在中間，代表太陽。另一說法是，由於十二名使徒，每三個為一組，共有四組，代表天啟四騎士（The Four Horsemen of the Apocalypse），而耶蘇則是降臨的神子（Advent Children）。
最後一個說法為，畫中耶蘇的雙手與頭部的角度，剛好成為一個正三角形，代表全視之眼的標誌。許多人也因為這幅畫的關係，認為李奧納多達文西與光明會的起源，有某種程度的連結。
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